文章来源:https://www.jianshu.com/p/2475c3240a67 简化的短序列匹配程序 (map.py) 把short.fa中的序列比对到ref.fa, 输出短序列匹配到ref.fa文件中哪些序列的哪些位置。 f1 = r'E:\Bioinformatics\Python\practice\chentong\notebook-master\data\short.fa' f2 = r'E:\Bio
时间序列数据是随着时间的推移反复捕获的变量值,随着时间的推移可以产生一系列的按时间顺序索引的数据点。在时间序列中,数据具有自然的时间顺序,即一个变量在特定时间的值依赖于过去的值。 传统的机器学习算法不能捕捉时间序列数据的时间顺序。数据科学家需要执行相关的特征工程,将
001、 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.fasta test.py (base) root@PC1:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >gene2 myc AGCTGCCTAAGC GGCATAGCTAATCG >gene1 jun ACCGAATCGGAGCGATG GGCATTAAAGATCTAGCT >gene4 malat1 AGGCTAGCGAG GCGC
前缀、序列型动态规划 给你一个整数数组 nums ,找到其中最长严格递增子序列的长度。 子序列 是由数组派生而来的序列,删除(或不删除)数组中的元素而不改变其余元素的顺序。例如,[3,6,2,7] 是数组 [0,3,1,6,2,2,7] 的子序列。 示例 1: 输入:nums = [10,9,2,5,3,7,101,18]输出:4解释:最长
001、 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.fasta test.py (base) root@PC1:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >gene1 myc AGCTGCCTAAGC GGCATAGCTAATCG >gene2 jun ACCGAATCGGAGCGATG GGCATTAAAGATCTAGCT >gene3 malat1 AGGCTAGCGAG GCGCGAG GATT
链接:https://ac.nowcoder.com/acm/contest/26896/1034来源:牛客网 题目描述 一天,小魂正和一个数列玩得不亦乐乎。 小魂的数列一共有n个元素,第i个数为Ai。 他发现,这个数列的一些子序列中的元素是严格递增的。 他想知道,这个数列一共有多少个长度为K的子序
Given an integer array nums, return the number of longest increasing subsequences. Notice that the sequence has to be strictly increasing. Solution 我们需要求出最长长度序列的个数。不妨用两个数组 \(dp1, dp2\). 其中 \(dp1[i]\) 表示以 \(i\) 结尾的最长递增序列的
链接:https://ac.nowcoder.com/acm/contest/26896/1027来源:牛客网 题目描述 给出一个序列,你的任务是求每次操作之后序列中 (a[j]-a[i])/(j-i)【1<=i<j<=n】的最大值。 操作次数有Q次,每次操作需要将位子p处的数字变成y. 输入描述: 本题包含多组输入
二叉树的前中序确定后序:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1710 二叉树的后中序确定层序:https://pintia.cn/problem-sets/994805342720868352/problems/994805485033603072 二叉树的前中序确定后序变形:https://pintia.cn/problem-sets/994805342720868352/problems/99480
题意 有一个长度为\(n\)的序列,每个位置可以填\(0\)到\(m-1\)之间的一个数,求有多少种构造序列的方式,使得构造出来的序列恰有\(t\)个连续子段满足和可以被\(m\)整除 \(1\leq{n,m}\leq64,0\leq{t}\leq\frac{n(n+1)}{2}\) 题解 本题的关键是要想到区间\([l,r]\)的和能被\(k\)整除,等
一、什么是序列化和反序列化?。 序列化:将内存中的对象转换成二进制流,转换成二进制流之后可以进行持久化和网络传输。简单来说就是将对象写入到IO流中。 反序列化:将二进制流的数据转换成对象。简单来说就是从IO流中恢复对象。 序列化机制允许将实现序列化的Java对象转换位字节序列
首先理解清楚,基因发生了正选择,并不表示该基因就是发生了趋同进化(适应趋同)。那么什么才是发生了适应趋同呢?一般定义为满足两个条件:1、处于正选择;2、现生物种氨基酸位点同祖先相比存在改变(而且最好是正选择位点同改变位点时同一位点)。 现生物种氨基酸位点同祖先相比存在变化可分为两
序列类型 字符串 由很多个字符组成的字符序列,字符串属于 **序列类型 序列简介 数值类型:可以表示 数字,数值 int float bool 序列类型:存储多个数据的一种数据类型 str : 可以存储数字,字母,特殊符号,中文等数据.表现形式为 一对引号包囊起来的数据 list 列表
元组与列表一样,也是一种序列。唯一不同的是元组不能修改。创建元组的方法很简单:如果你用逗号分割了一些值,那么你就自动创建了元组。 tuple = 1, 2, 3 print(tuple) 输出结果:(1, 2, 3) 元组也是(大部分时候是)通过圆括号括起来的; 空元组可以用没有包含内容的两个圆
题目大意: 就是给你一个长度为 \(n\) 的序列 \(a_i\) ,现在只能进行 \(+1\) 和 \(-1\) 的操作,问你最少需要多少步操作才能将原序列变为下标从 \(1\) 到 \(n\) ,且数值同样从 \(1\) 到 \(n\) 的序列。 题目分析: 这题我们可以使用贪心的策略,我们这样想: 将序列按从小到大的顺序排序后,每
目的:有两个序列文件,我们要把名字相同的序列首尾拼接起来 # ly-2021-08-29 version-01 # Usage: python infile1 infile2 > outfile # 每条序列必须处于同一行 a = [] b = [] with open("1.txt", "r+") as file1: for line1 in file1.readlines(): line1 = line.str
大家 令一个没有被点亮的点为根,设 \(f_{x,0/1/2,0/1}\) 表示 \(x\) 为根的子树里面有路径的 \(0/1/2\) 个端点,此时得到的不完成的序列使得 \(x\) 的开灭状态为 \(0/1\) 的最小序列长度 值得指出的是,$f_{x,2,*} 的常规理解是 \(x\) 子树中的序列在最终序列中分成两截,\(x\) 在第一截
一.使用Sql语句创建自增序列 1.创建自增序列 CREATE SEQUENCE sys_user_id_seq START WITH 1 INCREMENT BY 1 NO MINVALUE NO MAXVALUE CACHE 1; sys_user --- 需要添加自增序列的表名 id --- sys_user表的id字段 START WITH 1 --- 从1开始 INCREMENT BY 1 --- 每次自增1 NO MINV
CodeForces1602 Two Subsequences 解析: 题目大意 给你一个字符串 \(s\)。你需要两个非空字符串 \(a\) 和 \(b\) 并且满足下面的条件: 字符串 \(a\) 和 \(b\) 都是 \(s\) 的子序列。 对于原字符串的每一个字符,必须属于 \(a\) 和 \(b\) 之一。 \(a\) 是所有满足条件的字符串中字典序
线性DP 1.线性DP简介 线性DP这类动态规划问题的状态一般是一维的f[i],第i个元素的 最优值只与前i-1个元素的最优值(正推)或第i+1个元素 之后的最优值(倒推)有关。 2.经典例题(1):数字金字塔 观察下面的数字金字塔。写一个程序查找从最高点到底部任意处结束的路径,使路径经过数字的和最大。
只用ST表+二分的\(\mathcal O(N\log N)\)做法: 只考虑\(01\)序列的情况。不妨设\(a_{0}=a_1,a_{n+1}=a_n\),则\(1\)和\(n\)可以照常参加变换。 有长度\(>1\)的\(0\)或\(1\)连续段时其将稳定不变,将序列按照这些颜色相同的连续段分开。剩下若干\(0\)和\(1\)交错的连续段。若\(01\)连续
对于长度为2N的括号序列,合法的数量为C(2N,N)/(N+1) 参考:https://blog.csdn.net/ffmpeg4976/article/details/42340379?spm=1001.2101.3001.6650.3&utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7ECTRLIST%7Edefault-3-42340379-blog-105694263.pc_relevant_sort
背包问题 1.01背包问题 一件物品只能选一次 on^2复杂度 f[i][j]表示只看前i个物品,总体积为j的情况下,总价值最大 f[i][j]: 不选第i件物品 f[i][j]=f[i-1][j] 选第i件物品 f[i][j]=f[i-1][j-v[i]](在前i-1件物品中选择重量为j-v[i]的物品的价值)+w[i](第i件物品的价值) f[i][j]=max
link 题外话:蒟蒻 Feyn 在考场上成功地被这道题卡住了,两行的代码写了差不多两个小时一直憋不出来。另外有个小小的疑问,为啥其它同学最后的处理方法都和题解一毛一样呢,是我的思路过于非主流了还是什么…… 约定:假设 \(A\) 是一个序列,\(a\) 是一个元素,那么 \(A+a\) 是在序列后拼上一
子序列自动机 莫队集合 | 分块与莫队 位掩码 | 位掩码*2