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  • python 中实现 把short.fa中的序列比对到ref.fa2022-08-14 17:00:21

      文章来源:https://www.jianshu.com/p/2475c3240a67   简化的短序列匹配程序 (map.py) 把short.fa中的序列比对到ref.fa, 输出短序列匹配到ref.fa文件中哪些序列的哪些位置。 f1 = r'E:\Bioinformatics\Python\practice\chentong\notebook-master\data\short.fa' f2 = r'E:\Bio

  • 几行 Python 代码就可以提取数百个时间序列特征2022-08-14 09:02:02

    时间序列数据是随着时间的推移反复捕获的变量值,随着时间的推移可以产生一系列的按时间顺序索引的数据点。在时间序列中,数据具有自然的时间顺序,即一个变量在特定时间的值依赖于过去的值。 传统的机器学习算法不能捕捉时间序列数据的时间顺序。数据科学家需要执行相关的特征工程,将

  • python中实现依据序列名称排序并输出2022-08-13 23:03:45

      001、 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.fasta test.py (base) root@PC1:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >gene2 myc AGCTGCCTAAGC GGCATAGCTAATCG >gene1 jun ACCGAATCGGAGCGATG GGCATTAAAGATCTAGCT >gene4 malat1 AGGCTAGCGAG GCGC

  • 最长递增子序列-LIS2022-08-13 22:33:42

    前缀、序列型动态规划 给你一个整数数组 nums ,找到其中最长严格递增子序列的长度。 子序列 是由数组派生而来的序列,删除(或不删除)数组中的元素而不改变其余元素的顺序。例如,[3,6,2,7] 是数组 [0,3,1,6,2,2,7] 的子序列。  示例 1: 输入:nums = [10,9,2,5,3,7,101,18]输出:4解释:最长

  • python中提取原始序列名字第一个空格前的名字作为的序列名字,输出到屏幕2022-08-13 18:33:26

      001、 (base) root@PC1:/home/test2# ls a.fasta test.py (base) root@PC1:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >gene1 myc AGCTGCCTAAGC GGCATAGCTAATCG >gene2 jun ACCGAATCGGAGCGATG GGCATTAAAGATCTAGCT >gene3 malat1 AGGCTAGCGAG GCGCGAG GATT

  • 1034 小魂和他的数列 dp 树状数组 最长的递增序列数2022-08-13 15:31:40

     链接:https://ac.nowcoder.com/acm/contest/26896/1034来源:牛客网 题目描述 一天,小魂正和一个数列玩得不亦乐乎。 小魂的数列一共有n个元素,第i个数为Ai。 他发现,这个数列的一些子序列中的元素是严格递增的。 他想知道,这个数列一共有多少个长度为K的子序

  • LeetCode 673 Number of Longest Increasing Subsequence2022-08-13 02:01:10

    Given an integer array nums, return the number of longest increasing subsequences. Notice that the sequence has to be strictly increasing. Solution 我们需要求出最长长度序列的个数。不妨用两个数组 \(dp1, dp2\). 其中 \(dp1[i]\) 表示以 \(i\) 结尾的最长递增序列的

  • 1027 求最大值 线段树维护区间内斜率的最大值2022-08-12 03:30:08

     链接:https://ac.nowcoder.com/acm/contest/26896/1027来源:牛客网 题目描述 给出一个序列,你的任务是求每次操作之后序列中 (a[j]-a[i])/(j-i)【1<=i<j<=n】的最大值。 操作次数有Q次,每次操作需要将位子p处的数字变成y. 输入描述: 本题包含多组输入

  • binary tree+tree order2022-08-11 22:30:11

    二叉树的前中序确定后序:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1710 二叉树的后中序确定层序:https://pintia.cn/problem-sets/994805342720868352/problems/994805485033603072 二叉树的前中序确定后序变形:https://pintia.cn/problem-sets/994805342720868352/problems/99480

  • J-Melborp Elcissalc2022-08-11 02:05:21

    题意 有一个长度为\(n\)的序列,每个位置可以填\(0\)到\(m-1\)之间的一个数,求有多少种构造序列的方式,使得构造出来的序列恰有\(t\)个连续子段满足和可以被\(m\)整除 \(1\leq{n,m}\leq64,0\leq{t}\leq\frac{n(n+1)}{2}\) 题解 本题的关键是要想到区间\([l,r]\)的和能被\(k\)整除,等

  • 序列化和反序列化2022-08-10 22:31:32

    一、什么是序列化和反序列化?。 序列化:将内存中的对象转换成二进制流,转换成二进制流之后可以进行持久化和网络传输。简单来说就是将对象写入到IO流中。 反序列化:将二进制流的数据转换成对象。简单来说就是从IO流中恢复对象。 序列化机制允许将实现序列化的Java对象转换位字节序列

  • 202208祖先序列重构2022-08-08 10:03:38

    首先理解清楚,基因发生了正选择,并不表示该基因就是发生了趋同进化(适应趋同)。那么什么才是发生了适应趋同呢?一般定义为满足两个条件:1、处于正选择;2、现生物种氨基酸位点同祖先相比存在改变(而且最好是正选择位点同改变位点时同一位点)。 现生物种氨基酸位点同祖先相比存在变化可分为两

  • 序列类型2022-08-07 21:34:09

    序列类型 字符串 由很多个字符组成的字符序列,字符串属于 **序列类型 序列简介 数值类型:可以表示 数字,数值 int float bool 序列类型:存储多个数据的一种数据类型 str : 可以存储数字,字母,特殊符号,中文等数据.表现形式为 一对引号包囊起来的数据 list 列表

  • Python元组:不可变序列2022-08-07 15:33:34

      元组与列表一样,也是一种序列。唯一不同的是元组不能修改。创建元组的方法很简单:如果你用逗号分割了一些值,那么你就自动创建了元组。 tuple = 1, 2, 3 print(tuple)   输出结果:(1, 2, 3)   元组也是(大部分时候是)通过圆括号括起来的;   空元组可以用没有包含内容的两个圆

  • CF285C题解2022-08-07 10:02:06

    题目大意: 就是给你一个长度为 \(n\) 的序列 \(a_i\) ,现在只能进行 \(+1\) 和 \(-1\) 的操作,问你最少需要多少步操作才能将原序列变为下标从 \(1\) 到 \(n\) ,且数值同样从 \(1\) 到 \(n\) 的序列。 题目分析: 这题我们可以使用贪心的策略,我们这样想: 将序列按从小到大的顺序排序后,每

  • 拼接两个文件中名字相同的序列2022-08-07 08:00:08

    目的:有两个序列文件,我们要把名字相同的序列首尾拼接起来 # ly-2021-08-29 version-01 # Usage: python infile1 infile2 > outfile # 每条序列必须处于同一行 a = [] b = [] with open("1.txt", "r+") as file1: for line1 in file1.readlines(): line1 = line.str

  • 【考试总结】2022-08-042022-08-05 10:01:36

    大家 令一个没有被点亮的点为根,设 \(f_{x,0/1/2,0/1}\) 表示 \(x\) 为根的子树里面有路径的 \(0/1/2\) 个端点,此时得到的不完成的序列使得 \(x\) 的开灭状态为 \(0/1\) 的最小序列长度 值得指出的是,$f_{x,2,*} 的常规理解是 \(x\) 子树中的序列在最终序列中分成两截,\(x\) 在第一截

  • Postgresql自增序列2022-08-04 12:07:16

    一.使用Sql语句创建自增序列 1.创建自增序列 CREATE SEQUENCE sys_user_id_seq START WITH 1 INCREMENT BY 1 NO MINVALUE NO MAXVALUE CACHE 1; sys_user --- 需要添加自增序列的表名 id --- sys_user表的id字段 START WITH 1 --- 从1开始 INCREMENT BY 1 --- 每次自增1 NO MINV

  • Codeforces Round #751 (Div. 2)/CodeForces16022022-08-04 12:03:12

    CodeForces1602 Two Subsequences 解析: 题目大意 给你一个字符串 \(s\)。你需要两个非空字符串 \(a\) 和 \(b\) 并且满足下面的条件: 字符串 \(a\) 和 \(b\) 都是 \(s\) 的子序列。 对于原字符串的每一个字符,必须属于 \(a\) 和 \(b\) 之一。 \(a\) 是所有满足条件的字符串中字典序

  • 线性DP2022-08-02 23:35:37

    线性DP 1.线性DP简介 线性DP这类动态规划问题的状态一般是一维的f[i],第i个元素的 最优值只与前i-1个元素的最优值(正推)或第i+1个元素 之后的最优值(倒推)有关。 2.经典例题(1):数字金字塔 观察下面的数字金字塔。写一个程序查找从最高点到底部任意处结束的路径,使路径经过数字的和最大。

  • CF1322E2022-08-02 21:35:36

    只用ST表+二分的\(\mathcal O(N\log N)\)做法: 只考虑\(01\)序列的情况。不妨设\(a_{0}=a_1,a_{n+1}=a_n\),则\(1\)和\(n\)可以照常参加变换。 有长度\(>1\)的\(0\)或\(1\)连续段时其将稳定不变,将序列按照这些颜色相同的连续段分开。剩下若干\(0\)和\(1\)交错的连续段。若\(01\)连续

  • 全部括号序列2022-08-02 20:34:31

    对于长度为2N的括号序列,合法的数量为C(2N,N)/(N+1) 参考:https://blog.csdn.net/ffmpeg4976/article/details/42340379?spm=1001.2101.3001.6650.3&utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7ECTRLIST%7Edefault-3-42340379-blog-105694263.pc_relevant_sort

  • DP相关2022-08-02 18:35:11

    背包问题 1.01背包问题 一件物品只能选一次 on^2复杂度 f[i][j]表示只看前i个物品,总体积为j的情况下,总价值最大 f[i][j]: 不选第i件物品 f[i][j]=f[i-1][j] 选第i件物品 f[i][j]=f[i-1][j-v[i]](在前i-1件物品中选择重量为j-v[i]的物品的价值)+w[i](第i件物品的价值) f[i][j]=max

  • KLAVIR2022-08-02 12:31:27

    link 题外话:蒟蒻 Feyn 在考场上成功地被这道题卡住了,两行的代码写了差不多两个小时一直憋不出来。另外有个小小的疑问,为啥其它同学最后的处理方法都和题解一毛一样呢,是我的思路过于非主流了还是什么…… 约定:假设 \(A\) 是一个序列,\(a\) 是一个元素,那么 \(A+a\) 是在序列后拼上一

  • 一些优秀的笔记2022-08-01 23:34:02

    子序列自动机 莫队集合 | 分块与莫队 位掩码 | 位掩码*2

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