标签：学习 导出 初步 Pubmed 文件格式 格式 文献 VOSviewer

今天看到了colibactin的相关文献，想了解了解。在Pubmed上检索“colibactin”，得到近200篇文献，突然想可视化分析这些文献，看能否看到一些关键信息。百度看到了VOSviewer还不错，对新手比较友好，就决定是它了。

一、下载

下载网址：https://www.vosviewer.com/download
压缩包解压后，里面有.exe程序，直接运行即可。此外，还有英文说明书

二、上手

1.准备文献数据：
以“colibactin”为关键词，在Pubmed上检索：194条文献

导出数据：
新版和旧版Pubmed不太一样，没有Medline格式了，而VOSviewer支持的文件格式只有PubMed，不要选择别的~然后 Create file，导出为一个 .txt 文件

2.运行：初始界面

3.左侧栏点击 Create，界面比较好懂
目前只用到了第二个（基于bibliographic data 书目数据）和第三个（基于text文件），点进去都能看到支持的文件格式。这里选择第三个“Creat a map based on text data”

4.选第二个
“Read data from bibliographic database files”

5.选择Pubmed，导入刚刚下载的.txt文件

6.效果图呈现：
一路点击 Next，如果文件格式不支持，就会报错，没法进行下一步。有的文件可以选择是作者共现分析，或者是关键字共现分析。但是这个文件不可以，直接就是关键字分析了。
这图看着还挺有意思

三、其他尝试
1.Pubmed导出endnote可以识别的文件类型

导出文件的格式为 .nbib，可以直接endnote打开，endnote能读取所有文献，然后再export，可以导出为RIS格式，而VOSviewer是支持这个文献格式的。这个是参考别人转化CNKI导出格式想到的，来源：https://zhuanlan.zhihu.com/p/30970993

标签：学习,导出,初步,Pubmed,文件格式,格式,文献,VOSviewer
来源： https://blog.csdn.net/fan_tanker/article/details/117043265

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