c – 安装Stan for R和使用Rcpp时编译时出错

2019-07-29 11:17:47 阅读：317 来源： 互联网

标签：stan c r xcode compiler-construction

我需要为数据分析类安装Rstan.这些说明在这里发布http://code.google.com/p/stan/wiki/RStanGettingStarted.我正在运行Mac OS 10.5.8和R 2.15.1 GUI 1.52 Leopard构建32位(6188).我刚刚安装了Xcode 3.1.4版,与leopard兼容的Xcode c编译器(我必须得到一个mac开发者帐户才能执行此操作).

根据Stan安装说明,我输入以下代码以查看我的编译器是否正常工作：

library(inline) 
library(Rcpp)
src <- ' 
  std::vector<std::string> s; 
  s.push_back("hello");
  s.push_back("world");
  return Rcpp::wrap(s);
'
hellofun <- cxxfunction(body = src, includes = '', plugin = 'Rcpp', verbose = FALSE)
cat(hellofun(), '\n')

它返回以下错误：

Error in compileCode(f, code, language = language, verbose = verbose) :
Compilation ERROR, function(s)/method(s) not created! 
Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/
Rcpp/include/Rcpp/internal/export.h: In function ‘void
Rcpp::internal::export_range__dispatch(SEXPREC*, InputIterator,
Rcpp::traits::r_type_primitive_tag)’:
/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/
library/Rcpp/include/Rcpp/internal/export.h:56: internal
compiler error: Bus error
Please submit a full bug report,
with preprocessed source if appropriate.
See <URL:http://developer.apple.com/bugreporter> for
instructions.
make: *** [file795214e66510.o] Error 1
In addition: Warning message:
running command '/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/
R CMD SHLIB file795214e66510.cpp 2>
file795214e66510.cpp.err.txt' had status 1

当我尝试安装stan时：

 install.packages('rstan', type = 'source') ]

我收到这个警告：
    警告信息：
    在install.packages(“rstan”,type =“source”)中：
      包’rstan’的安装具有非零退出状态

我不知道C是如何工作的.我的所有编码经验都在R中,并且之前没有要求编译成C语言.我一直在努力弄清楚过去4个小时左右出了什么问题,一遍又一遍地搜索这些错误信息而没有太多运气.任何帮助将不胜感激,也将帮助我班上其他10个有相同或类似问题的学生.非常非常感谢你.

解决方法:

这看起来像是安装C编译器或安装Rcpp软件包的问题,而不是rstan软件包的问题.但是,如果g给你带来了一个棘手的问题,那么另一个是clang编译器,如果用这两行创建$HOME / .R / Makevars,它应该与Rcpp和rstan一起使用

CC =铛

CXX =铛

标签：stan,c,r,xcode,compiler-construction
来源： https://codeday.me/bug/20190729/1570978.html

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