标签:ENSG00000000938 dict1 temp python 0.0 ENSG00000000457 矩阵 三元组 ENSG00000000460
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root@PC1:/home/test3# ls a.txt test.py root@PC1:/home/test3# cat test.py ## 测试程序 #!/usr/bin/python in_file = open("a.txt", "r") lines = in_file.readlines()[1:] dict1 = dict() list1 = list() for i in lines: temp = i.strip().split() if temp[0] not in dict1: key1 = temp[0] dict1[key1] = {} key2 = temp[1] dict1[key1][key2] = temp[2] else: key2 = temp[1] dict1[key1][key2] = temp[2] for i,j in dict1.items(): for k in j: if k not in list1: list1.append(k) print("gene\\name" + "\t" + "\t".join(list1)) for i,j in dict1.items(): print(i, end = "\t") for k,l in j.items(): print("\t{}".format(l), end = "") print("") in_file.close() root@PC1:/home/test3# cat a.txt ## 测试数据 Gene Sample Value ENSG00000000460 A-431 25.2 ENSG00000000460 A-549 14.2 ENSG00000000460 AN3-CA 10.6 ENSG00000000460 BEWO 24.4 ENSG00000000460 CACO-2 14.2 ENSG00000000938 A-431 0.0 ENSG00000000938 A-549 0.0 ENSG00000000938 AN3-CA 0.0 ENSG00000000938 BEWO 0.0 ENSG00000000938 CACO-2 0.0 ENSG00000001084 A-431 19.1 ENSG00000001084 A-549 155.1 ENSG00000001084 AN3-CA 24.4 ENSG00000001084 BEWO 12.6 ENSG00000001084 CACO-2 23.5 ENSG00000000457 A-431 2.8 ENSG00000000457 A-549 3.4 ENSG00000000457 AN3-CA 3.8 ENSG00000000457 BEWO 5.8 ENSG00000000457 CACO-2 2.9 root@PC1:/home/test3# python test.py | column -t ## 程序运行结果 gene\name A-431 A-549 AN3-CA BEWO CACO-2 ENSG00000000460 25.2 14.2 10.6 24.4 14.2 ENSG00000000938 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 ENSG00000001084 19.1 155.1 24.4 12.6 23.5 ENSG00000000457 2.8 3.4 3.8 5.8 2.9
参考:https://www.jianshu.com/p/2475c3240a67
标签:ENSG00000000938,dict1,temp,python,0.0,ENSG00000000457,矩阵,三元组,ENSG00000000460 来源: https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/16585451.html
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