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  • python 中实现 把short.fa中的序列比对到ref.fa2022-08-14 17:00:21

      文章来源:https://www.jianshu.com/p/2475c3240a67   简化的短序列匹配程序 (map.py) 把short.fa中的序列比对到ref.fa, 输出短序列匹配到ref.fa文件中哪些序列的哪些位置。 f1 = r'E:\Bioinformatics\Python\practice\chentong\notebook-master\data\short.fa' f2 = r'E:\Bio

  • 闭包2022-08-14 12:31:26

    在一个外函数中定义了一个内函数,内函数里运用了外函数的临时变量,并且外函数的返回值是内函数的引用。这样就构成了一个闭包。闭包具有提高代码复用性的作用。 def line_cof(a,b): def line(x): return a*x+b return line line1 = line_cof(1,1) # x+1 line2

  • PA Note2022-08-14 09:30:45

    PA Note Linux # $sudo apt update # $whereis <name> Vim 0 line start, $ line end /word search "word", n find next, N find previous d0 delete until line start, d$ delete until line end, dd cut current line y0 copy until line start, y$ c

  • Jupyter Notebook切换内核无法打开2022-08-13 18:30:08

    报错如下所示: [I 18:13:05.891 NotebookApp] KernelRestarter: restarting kernel (4/5), new random ports Traceback (most recent call last): File "D:\Anaconda\Main\envs\tensorflow2.4.1\lib\runpy.py", line 194, in _run_module_as_main return _r

  • 两个列表对数问题2022-08-12 21:05:14

    问题描述:数据库表中的数据较之系统中的数据缺少了1000条左右,现有数据库表中每条记录的编码和系统中每条记录的编码,要求列出系统中有而数据库表中没有的所有编码。 f1 = open('./nc_code.txt',encoding='UTF-8') f2 = open('./sql_code.txt',encoding='UTF-8') sql_ls,nc_ls = [],[

  • line-height 和 height的区别2022-08-10 14:30:53

    含义不同 line-height是行高的意思,它决定了元素中文本内容的高度 height则是定义元素自身的高度 height使用 <style> ul{ width: 500px; font-size: 20px; background-color: red; height: 50px; } li{ } </

  • buuctf | [极客大挑战 2019]HardSQL2022-08-08 19:30:08

    时间:August 8 2022 经过测试发现 闭合用单引号 过滤了空格等字符和sql关键词,用%20、%0a、/**/来绕过都不行 fuzzing一下,看有哪些关键词和字符被过滤了: import requests with open('Sql.txt') as f: for line in f: line = line.replace('\n','') url = f'h

  • 快速查找 awk 常用命令2022-08-08 11:03:14

    awk 列打印 功能 助词词 命令 意义 替换 substitute sed -i 's/dog/cat/g' file 将 file 中的 dog 替换为 cat sed -i '2s/dog/cat/' file 将 file 第 2 行的 dog 替换为 cat sed -i '2,3s/dog/cat/' file 将 file 第 2~3 行的 dog 替换为 cat sed -i '2,

  • 202208祖先序列重构2022-08-08 10:03:38

    首先理解清楚,基因发生了正选择,并不表示该基因就是发生了趋同进化(适应趋同)。那么什么才是发生了适应趋同呢?一般定义为满足两个条件:1、处于正选择;2、现生物种氨基酸位点同祖先相比存在改变(而且最好是正选择位点同改变位点时同一位点)。 现生物种氨基酸位点同祖先相比存在变化可分为两

  • vim配置(Linux)2022-08-07 21:30:30

    " Setting some decent VIM settings for programming " This source file comes from git-for-windows build-extra repository (git-extra/vimrc) ru! defaults.vim " Use Enhanced Vim defaults set mouse=a " Us

  • python 将txt文件转为csv文件2022-08-07 12:36:04

    import csv a = [] f = open('follow_name_1.txt','r',encoding='utf-8') line = f.readline() while line: a.append(line.split())#保存文件是以空格分离的 line = f.readline() f.close() fp = open('follow_name_1.csv','w

  • oma同源基因查找2022-08-07 09:30:31

    oma查找同源基因【最终需要从HOGFasta文件夹中提取文件】 #同源基因的另一种查找方法oma (https://omabrowser.org/standalone)##################################################### wget -O oma.tgz https://omabrowser.org/standalone/OMA.2.4.2.tgz # on MacOS you can als

  • 拼接两个文件中名字相同的序列2022-08-07 08:00:08

    目的:有两个序列文件,我们要把名字相同的序列首尾拼接起来 # ly-2021-08-29 version-01 # Usage: python infile1 infile2 > outfile # 每条序列必须处于同一行 a = [] b = [] with open("1.txt", "r+") as file1: for line1 in file1.readlines(): line1 = line.str

  • Rust 错误2022-08-06 21:04:36

    一个简单的需求:读入一个目录内的所有文本文件,每个文件的格式都是每一行定义一个二维点,例如x=1,y=2;获取所有点的一个列表。这里不使用serde或者现成的parser库,这么简单的格式直接手写就行了   没有错误处理 先来一个糙快猛的版本。其中用了一个nightly feature str_split_once,不过

  • [c++]关于拷贝构造函数和析构函数执行次数的思考2022-08-05 16:00:24

    前言 最近在学习C++的类如何构造,在W3Cschool上看到关于拷贝构造函数的一个例子,记录一下。 案例背景 这篇文章大致是构造了如下的一个Line类: class Line{ public: int getLength(void); Line(int len); // 简单构造函数 Line(const Line &obj

  • yolov7 _pickle.UnpicklingError: STACK_GLOBAL requires str 问题修复2022-08-05 14:32:21

    问题现象 在启动训练时候报错了   1 Model Summary: 415 layers, 37201950 parameters, 37201950 gradients, 105.1 GFLOPS 2 3 Scaled weight_decay = 0.0005 4 Optimizer groups: 95 .bias, 95 conv.weight, 98 other 5 Traceback (most recent call last): 6 File "

  • Oracle 相关基础1-变量2022-08-04 22:31:57

    PL/SQL表示SQL的过程式语言扩展(Procedural Language Extension to SQL)。 通过添加任何高级语言所拥有的编程结构和子程序, PL/SQL实现了对SQL的扩展 PL/SQL可用于服务器端(Oracle数据库)和客户端(Oracle Forms等)开发 PL/SQL不是独立的编程语言,它是Oracle RDBMS的一部分 c/s c:客户

  • java笔记__读取文件内容2022-08-03 15:35:26

    public JSONObject toGetFileData(Integer model){ //用于存储文件内容 String jsonString = ""; InputStream is = null; try { is = new FileInputStream("D:\\data\\xxxxx.txt"); //用来保存每行读取

  • 使用python爬虫爬取新冠疫情数据并进行可视化展示2022-08-02 11:32:29

     新冠疫情爆发对全国造成重大影响,各行各业因为疫情皆受到不小的波及。如何编写一个python程序爬取疫情数据,实现新冠疫情数据可视化并以大屏形式展现到屏幕供人们观看与使用, 下面我将一步步介绍该程序实现流程.   下载程序所需要的库 pip install xxxx (xxxx为所需库的名称

  • vscode插件-ToDo Tree (待办事项插件)2022-08-02 00:00:08

    简介 Todo Tree是vscode中一款可以在侧边栏记录TODO注释(也可以配置其他的注释)并且可以高亮注释行的很优秀的插件。有的时候我们写程序的时候,难免会遇到一些情况需要标记或者搁置,在写代码的时候会用一些特殊的注释来表示不同的内容,使我们可以快速的定位我们注释的位置。 配置步骤

  • 牛客 HJ10 字符个数统计(Java 哈希表)2022-07-31 18:31:57

                思路: 使用哈希表。 获得输入之后,挨个检查字符。只要不是/n换行符,就继续进行: 字符是否是ASCII码范围,0-127包括0,127。若是,则查看哈希表中有无该字符,若有则不做动作,若无则计数+1。 若不是范围,也不做动作。   1 import java.io.BufferedReader; 2 import java

  • [ACTF新生赛2020]base64隐写2022-07-29 21:02:48

    [ACTF新生赛2020]base64隐写 有一个txt文件,看着很想base64加密,直接解密,发现不能直接解出来 根据网上搜索的做法是base64隐写,用脚本直接能跑出来 #encoding:utf-8 def get_base64_diff_value(s1, s2): base64chars = 'ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefghijklmnopqrstuvwxyz012

  • Codeforces Round #810 (Div. 2)2022-07-29 18:33:59

    比赛链接 链接 A. Perfect Permutation 原题链接 链接 time limit per test1:second memory limit per test:256 megabytes inputstandard:input outputstandard:output You are given a positive integer n. The weight of a permutation p1,p2,…,pn is the number of indices 1≤i

  • linux sed基础命令详解2022-07-27 23:05:16

    sed编辑器即流编辑器(stream editor),与普通交互式文本编辑器不同(比如vim),vim你可以通过键盘命令去交互式的插入、删除或替换数据中的文本;而流编辑器则会在编辑器处理数据之前基于预先提供的一组规则来编辑数据流。 操作过程: (1)  一次从输入中读取一行数据。(2)  根据所提供的编

  • 利用python 在txt中添加指定内容2022-07-27 17:03:31

    利用python 在txt中添加指定内容 一、原txt的内容   二、添加内容后的txt   三、代码   import os # 文件夹的路径 scr = 'E:\DATASET\Main' # 获取文件夹下的txt的文件名 fs = os.listdir(scr) print(fs) for fz in fs: # txt文件路径 src_folder = scr + "\\"

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