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MelonnPan:Predictive metabolomic profiling of microbial communities using amplicon or metagenomic sequences 前言摘要结论 引言结果1.The MelonnPan algorithm2.MelonnPan accurately predicts metabolites from metagenomes3.Estimating MelonnPan accuracy in new
R包ropls的偏最小二乘判别分析（PLS-DA）和正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA） Original 生信小白鱼 鲤小白 小白鱼的生统笔记 2020-01-08 收录于话题 #多变量的降维分析35 #聚类和分类23 R包ropls的PCA、PLS-DA和OPLS-DA在代谢组学分析中经常可以见到主成分分析（PCA）、偏最小二乘
同位素未标记13C标记和2H标记的2,4-二氯苯氧乙酸（2,4-D）处理拟南芥属T87细胞 建立高准确度和普适性的外源性代谢物检测和鉴定分析方法对于评价药物等化合物的安全性至关重要。基于液相色谱-四极杆串联高分辨质谱技术（LC/HRMS/MS），先应用稳定同位素标记目标原型化合物（13C和2H），再进行特
目的 和转录组或蛋白组的分析原理类似，目的是： 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路，方便解释科学问题； 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物学原理/过程。 富集分析方法 富集分析的本质：某个代谢通路在不同的状态下（如疾病与健康）是否发生了显著变化？ ORA富集 回答的问
文章简介 微生物组的热度已经持续几年了，目前热度依旧不减，感觉肠道微生物是一个可以影响机体任何表型的东西。相关研究者称，动物具有两套基因组，一套是父母遗传的，一套是出生后微生物带来的；中医学认为，体质是由先天遗传和后天禀赋共同影响的，先天遗传也就是第一套基因组决
MetaboAnalyst是做代谢的R包，功能十分强大。也开发了web版本，代谢组学的分析这里不介绍，主要讲讲它开发的多组学分析的相关内容。 既然是做代谢的工具，即使是增加了多组学内容，肯定也是以代谢为核心。以代谢组为中心的多组学分析想想无非就是以下几点：多元变量统计分析、网络分析、pathw
