标签：分子 undersirable 重复 144564 天然 Fliter Sybyl 产物

用Sybyl对3个天然产物库处理

•包括简单的去重复分子和3D构象生成（没有对Bad group进行去除）

•1、 Chemdiv 得到8124个分子，重复分子2510个分子 
•2、 Zinc得到96991个分子，重复分子70513个分子 
•3、 J&K得到84712个分子，重复分子8788个分子 

•将3个库合并得到189827个分子，去重后得到144564个分子
由于表单过大，导致SYBYL对接过程中断及无法打开等情况，采取将数据库拆分及其他的方法重新进行操作；

用Sybyl进行二次处理144564个化合物，根据1 、 2 、3 三个不同方法

    1、Fliter by undersirable substructures
    2、Fliter by Standard Lipinski Rules
    3、Fliter using PAINS 

总结：
1、 Fliter by undersirable substructures
2、 Fliter by Standard Lipinski Rules
3、 Fliter using PAINS
1、 144564 = 67873 + 76691
2、 144564 = 100097 + 44467
3、 144564 = 129674 + 14890
12、 144564 = 45322 + 99242
23、 144564 = 91554 + 53010
123、144564 = 80181 + 64383
其中1包含3

Fliter by undersirable Substructures 包含右图的表单， 共38类结构

标签：分子,undersirable,重复,144564,天然,Fliter,Sybyl,产物
来源： https://blog.csdn.net/boqiang531/article/details/111855626

本站声明： 1. iCode9 技术分享网（下文简称本站）提供的所有内容，仅供技术学习、探讨和分享；
2. 关于本站的所有留言、评论、转载及引用，纯属内容发起人的个人观点，与本站观点和立场无关；
3. 关于本站的所有言论和文字，纯属内容发起人的个人观点，与本站观点和立场无关；
4. 本站文章均是网友提供，不完全保证技术分享内容的完整性、准确性、时效性、风险性和版权归属；如您发现该文章侵犯了您的权益，可联系我们第一时间进行删除；
5. 本站为非盈利性的个人网站，所有内容不会用来进行牟利，也不会利用任何形式的广告来间接获益，纯粹是为了广大技术爱好者提供技术内容和技术思想的分享性交流网站。