标签:signac seq Transcription 染色质 TF scATAC scRNA
终于要开始分析scATAC-seq数据了,联合scRNA-seq就可以做multi-omics,可以深入挖掘TF的调控机制。
基本教程:
分析工具:
signac - https://github.com/timoast/signac
- QC
- PCA and UMAP
- peak to gene
- integration with scRNA-seq
- DE Peaks
- CoveragePlot
- TF footprinting
TF转录因子高级分析
Transcription factors
General and specific transcription factors. Transcription initiation complex & looping. Combinatorial regulation.
待续~
标签:signac,seq,Transcription,染色质,TF,scATAC,scRNA 来源: https://www.cnblogs.com/leezx/p/16546704.html
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