标签：circos 服务器上安装 GD 模块 Linux 2.2 libgd 安装 CirCos

在linux下安装：
1.官网下载压缩包
2.目录下解压：$ tar xvf circos-0.68.tar
3.生成软连接
ln -s circos-0.68 current
ls
4.写入当前用户的环境变量中
vi ~/.bash_profile
5.写入环境变量
export CIRCOS_HOME=${HOME}/softWare/current
export PATH=${PATH}:${CIRCOS_HOME}/bin
6.激活环境变量（相当于重启用户登录）
source ~/.bash_profile
7.输入 echo $PATH 查看刚刚设置的环境变量是否在其中
8.输入 circos 进入circos页面
9.在 /public/home/xiayy/softWare/current/bin 路径下 输入 ./list.modules 列出需要安装的模块
10.安装所需模块，使用默认设置 perl -MCPAN -e shell
cpan[1]> install 需要安装的模块名称
cpan[1]> exit 退出模块安装模式

11.此处会有两个GD模块很难安装：（安装难点）
解决办法：安装libgd库 安装路径/public/home/xiayy/softWare/current/bin下面解压安装
wget https://github.com/libgd/libgd/releases/download/gd-2.2.5/libgd-2.2.5.tar.gz
tar zxvf libgd-2.2.5.tar.gz
cd libgd-2.2.5
./ configure -prefix =/home/xiayy/softWare/circos-0.69 （此处非root用户，或者只是在自己目录下有效）
make
make install
make installcheck

12.然后再去安装两个GD模块：
cpan[1]> install GD.pm
cpan[2]> install GD::Polyline
cpan[3]> reload cpan
cpan[4]> exit

13.测试所有模块是否安装成功 输入 circos
无报错则成功！

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来源： https://www.cnblogs.com/xinjianheyi/p/CirCos.html

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