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Java中的朴素后缀树实现

2019-11-20 18:13:19  阅读:263  来源: 互联网

标签:suffix-tree java algorithm


我正在尝试使用O(m ^ 2)而非Ukkonen的幼稚构建算法编写后缀树类.

我的疑问是关于如何表示树.到目前为止,我已经知道了.但是我不认为这是节点和边缘的写类结构.关于如何维护节点与边缘之间的映射/关系的任何建议.重要的一点是,在edge中,我们仅存储开始索引和结束索引以节省空间.

class suffixTree{
Node[] nodes;
Edge[] edge;
}

class Node{
  int node_id;
  Edge[] outgoingEdges;
}

class Edge{
  int start_index;
  int end_index;
  int start_node_id;
  int end_node_id;
}

解决方法:

我会这样:

class SuffixTree {
    // A tree only needs to know about the root Node.
    Node root;
}

// A Node contains a mapping from the first character to
// an Edge that corresponds to it.
// It doesn't need to know about anything else.
class Node {
    Map<Character, Edge> edgeMap;
}

// An Edge contains only the start and the end index of the substring
// and the destination Node.
class Edge {
    int startIndex;
    int endIndex;
    Node destination;
}

最重要的更改是:

>摆脱所有三个类别中的冗余信息.
>使用引用代替数组和索引.

标签:suffix-tree,java,algorithm
来源: https://codeday.me/bug/20191120/2045881.html

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