标签：文件 python RECList transList 行与行 int rho SNPPosList line

在处理文本文件时，很多时候需要我们处理跨行的数据，但是用for循环处理不是很方便，想了一个歪招来处理不是很大的数据。

核心思想就是将上一行的东西存在一个列表里，到下一行用完这个数据在循环体里将列表初始化，再将这行数据存到列表里，这样循环就可以把两行数据联系起来。

另外这样做的还有另外一个好处，就是可以初始化第一行，我们可以通过判断这个“传递列表”空与否来区分标题行的输入和其他循环体的输入情况。

from __future__ import division

from sys import argv

from itertools import islice

Mutation = open('DivFile_sort_chr' + argv[1] +'.txt',"r")

REC = open('GeneticMap_Chr' + argv[1],"r")

RECList = open('REC_Chr_' + argv[1], "a")

transList = []

SNPPosList = []

rholist = []

for lines in islice(Mutation, 1, None):
    
    line = lines.strip('\n').split("\t")
    
    POS = line[0]
    
    SNPPosList.append(POS)

print "SNPPos done"

for lines in islice(REC, 1, None):
    
    line = lines.strip('\n').split("\t")
    
    if transList == []:
        
        transList.append((line[0],line[1]))


        
        RECList.write("position\trate\n")
        
        RECList.write('%s\t%s\n' %(line[0],0))

        print "headline"
        
    else:
        
        rho = (float(line[1]) - float(transList[0][1])) / (float(line[0]) - float(transList[0][0]))
        
        for i in SNPPosList:
            
            if int(i) < int(line[0]) and int(i) > int(transList[0][0]):
                
                index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
                
                site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
                
                RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
            
            else:
                
                continue
            
        transList = []
        
        transList.append((line[0],line[1],rho))

        rholist.append(rho)

print rholist
        
for i in SNPPosList:
    
    if i > int(transList[0][0]):
        
        index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
        
        site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
        
        RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
        
    else:
        
        continue
    
Mutation.close()

REC.close()

RECList.close()

标签：文件,python,RECList,transList,行与行,int,rho,SNPPosList,line
来源： https://www.cnblogs.com/muuyouzhi/p/10494093.html

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